[Comparatif] Choisissez le meilleur logiciel comptable pour votre entreprise

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour votre entreprise ?

La comptabilité est souvent perçue comme une contrainte, mais elle est pourtant la clé d’une gestion d’entreprise saine. Le choix de votre logiciel n’est donc pas anodin.

L’offre de logiciels de comptabilité est très développée sur le marché, et les fonctionnalités variées : mais alors, comment bien choisir son logiciel de comptabilité ? Si votre budget est très serré, il se peut même que vous soyez en quête du meilleur logiciel comptable gratuit.

Découvrez notre sélection de logiciels comptables en fonction de la taille de votre entreprise et de vos besoins, et notre guide pour vous aider dans votre choix.

Et si, à la fin de la lecture, vous aviez trouvé votre logiciel idéal ?

Un logiciel comptable permet de tenir votre comptabilité et d’automatiser les tâches comptables. Il centralise les données comptables de votre entreprise au sein d’un même outil et rationalise les processus. Il concerne tous les aspects de la comptabilité d’entreprise :

• comptabilité générale : entrées/sorties, génération des écritures comptables, préparation du budget, gestion du budget, comptes, balances, journaux, Grand Livre, etc. ;
• devis et facturation : gestion des devis et factures, bons de commande en quelques clics ;
• gestion des fournisseurs ;
• liasse fiscale ;
• gestion des immobilisations, etc.

Un tel logiciel vous permet également un meilleur suivi de votre comptabilité grâce aux indicateurs de performance et aux tableaux de bord pour piloter votre activité.

Vous pensez qu’Excel suffit à gérer tous les aspects de votre comptabilité ? Vous avez toujours fait comme cela et ne voyez pas d’intérêt à changer ? Il est temps de professionnaliser votre gestion comptable.

En réalité, un logiciel comptable s’avère être un outil indispensable pour gérer votre comptabilité d’entreprise, et ce pour plusieurs raisons :

• la diminution du risque d’erreur (doublons, saisies incorrectes, formules obsolètes, etc.) ;

• l’automatisation des tâches et process (envoi des factures, gestion de la TVA, catégorisation des factures, etc.) ;

• une meilleure visibilité de votre comptabilité, vous permettant de planifier la stratégie de l’entreprise plus précisément ;

• l’optimisation des coûts du fait de l’automatisation, qui génère un gain de temps ;

• les mises à jour automatiques, permettant d’être en conformité avec la réglementation en vigueur ;

• la collaboration intégrée aux logiciels comptables pour partager les données en interne et faciliter les échanges avec un expert-comptable ;

• la mobilité, pour accéder au logiciel depuis n’importe quel lieu.

☝️ Attention aux logiciels de comptabilité Open Source, ils ne sont pas conformes à la loi finances.

Il existe de nombreux logiciels comptables professionnels gratuits et payants sur le marché. Nous avons sélectionné pour vous 19 solutions. Et pour vous aider à choisir, nous les avons rangées par type d’entreprises.

Tableau comparatif des logiciels de comptabilité

Sachez qu’il existe des logiciels gratuits qui peuvent suffire à répondre à vos besoins. Ils conviennent davantage aux TPE et start-up voire aux PME. Leur gratuité est un argument de poids s’ils proposent toutes les fonctionnalités dont vous avez besoin.

Cette suite de logiciels en ligne a pour vocation d’aider les entreprises à automatiser un maximum de tâches et de processus. E-commerce, facturation, comptabilité : Apache OFBiz propose différents modules pour tout gérer, ou presque. Open source, cet ERP propose une documentation riche aux développeurs pour adapter facilement le logiciel à toutes vos spécificités.

© Apache OFBiz

Fonctionnalités d’Apache OFBiz pour votre comptabilité :

• gestion des relations fournisseurs,
• facturation et paiements,
• grand livre général, comptable, etc.

Ce logiciel est une solution open source gratuite vous permettant d'avoir un support de gestion avec une large gamme de fonctionnalité dont la comptabilité. Cette dernière est une partie essentielle de Dolibarr, elle vous permet un suivi de vos activité à tous les niveaux. 

Fonctionnalités : 

• Adaptabilité à toutes tailles d'entreprise ou d'activité grâce à son accès open source 
• Devis et factures
• gestion des règlements
• suivi comptable (chiffre d’affaires, Charge, Ressource...)
• gestion des comptes bancaires

Cette solution aide les TPE et PME au quotidien à gérer leur comptabilité. Elle est accessible gratuitement aux entreprises avec 5 utilisateurs maximum. Accessible en ligne, elle fonctionne sous Windows et sous Mac et vous permet de suivre en temps réel votre balance comptable.

© NCH Software

Fonctionnalités de Express Accounts pour votre comptabilité :

• encaissements, achats et paiements,
• plus de 20 rapports financiers, transmissibles directement à l’expert-comptable,
• devis et des factures,
• comptabilité client (ventes, enregistrement des commandes),
• relations fournisseurs (comptabilité, suivi des paiements, impression de chèques).

IPaidThat est une solution SaaS permettant de d'automatiser la gestion comptable et financière. Cet outil comptable permet aux TPE et PME de trouver un véritable support de suivi comptable et de création de document comptable. IPaidThat vous fais gagner du temps, l'automatisation des processus est au cœur des valeurs de cette solution. Si vous cherchez à optimiser la gestion et le suivi comptable de votre entreprise à moindre coût, IPaidThat est fait pour vous.

Fonctionnalités : 

• Automatisation des process comptables 
• Éditeur de devis et factures 
• Rapprochement bancaire
• Notes de frais 
• Tableau de suivi de résultat

JePilote vous permet de gérer toute votre comptabilité en ligne gratuitement la première année, mais pas que : facturation, gestion des documents et fonctionnalités collaboratives en font un logiciel idéal quand on est micro-entrepreneur ou qu’on lance sa TPE ou sa startup. Le plus ? Vos données sont sauvegardées et hébergées en France, en toute sécurité !

Fonctionnalités de JePilote pour votre comptabilité :

• gestion de la comptabilité générale et auxiliaire,
• saisie des écritures comptables simplifiées,
• déclaration de la TVA,
• tableau de suivi de la trésorerie,
• état de rapprochement bancaire.

Simplifiez la saisie de vos écritures comptables avec le logiciel Ciel Compta. De l’édition du bilan au suivi de votre trésorerie, cette solution à faible coût est idéale pour tous les types d’entreprises. Qui plus est, elle a pour point fort d’être couplée avec Office 365 pour augmenter votre productivité.
Attention : Ciel Compta n’est pas un logiciel en ligne, mais il faudra disposer d’une licence monoposte.

Ses avantages :

• tableau de bord ergonomique,
• plan comptable personnalisable,
• couplage avec Office 365 : accès à vos outils bureautiques sur mobile, tablette ou ordinateur.

Le logiciel Compta.com est issu d’un réseau de cabinets d’expertise-comptable, ouvert à tous les entrepreneurs. Il permet de piloter votre entreprise où que vous soyez, à partir de tous les appareils offrant une connexion internet : PC, Mac, tablette tactile, smartphone, etc.

Le module Compta propose notamment les fonctionnalités suivantes :

• l’utilisation individuelle sans connaissance préalable requise par un expert-comptable ; 
• l’automatisation de la comptabilisation des opérations bancaires importées et des factures numérisées ;
• la synthèse de la comptabilité : état d’avancement de votre dossier, accès rapide à la saisie, recherche immédiate d’opérations, etc.

Le logiciel EBP Compta accompagne les entreprises dans la gestion automatisée de leur comptabilité. Le support qu’ils offrent est un atout par rapport à d’autres outils. Vous avez la possibilité de donner un accès à votre expert-comptable pour simplifier l’échange de vos données comptables.
Sans engagement : vous avez la liberté de résilier votre abonnement à tout instant.

Ses avantages :

• assistance téléphonique par des experts compétents,
• import et export des données paramétrables et facilités.

Fred de la compta est une plateforme de mise en relation qui réunit les dirigeants d’entreprise et les experts-comptables. En tant que chef d’entreprise, vous disposez d’un profil comptable englobant les besoins et les spécificités de votre activité et Fred se charge de trouver l’expert adapté qui vous propose toutes les missions « classiques » d’un cabinet d’expertise-comptable, tout en vous offrant du conseil de qualité.

Cette solution se décline à la fois sur une application mobile et sur une plateforme web afin de digitaliser l’ensemble des échanges entre le cabinet comptable et votre entreprise. Elle offre notamment :

• la transmission simplifiée des documents et pièces comptables (factures, notes de frais, documents administratifs, etc.) via l’application mobile, la plateforme web et la boîte email ;
• la connexion aux comptes bancaires
• un système de messagerie intégrée à la plateforme avec la centralisation et sauvegarde des échanges, ainsi que l’attribution intelligente du bon interlocuteur,
• un espace de stockage des pièces comptables doté d’un puissant moteur de recherche.

Mister Compta est une solution entièrement en ligne, fiable et sécurisée, pour automatiser vos processus de gestion comptable. Elle vous permet de simplifier votre comptabilité et de gagner du temps grâce à une automatisation entière ou partielle des tâches administratives.

L’outil Mister Compta promet notamment les avantages suivants :

• jusqu’à 100 % de votre comptabilité automatisée avec la récupération et catégorisation automatique de vos opérations bancaires,
• des fonctions de tri et de recherche puissantes (par date, libellé, rubrique, commentaire, etc.),
• des tableaux de bord en temps réel avec une visibilité globale sur toutes vos activités, projets, dépenses, chiffre d’affaires, etc.,
• une interface simple, intuitive et ludique.

Zefyr est un logiciel complet 100 % en ligne qui vous permet de faire votre comptabilité en toute autonomie grâce à une interface intuitive et accessible à tous. Vous pouvez ainsi piloter votre activité en temps réel et prendre les décisions adaptées, grâce à une vision claire de la situation financière de votre entreprise, sans requérir de connaissances en comptabilité.

Le logiciel Zefyr vous propose : 

• un fonctionnement sans installation ni maintenance requises, sur toutes les applications,
• une vision en temps réel de votre trésorerie et de l’évolution de votre chiffre d’affaires,
• un nombre illimité d’utilisateurs,
• des sauvegardes automatiques,
• un essai gratuit pendant 30 jours, sans engagement,

Vous faites votre comptabilité vous-mêmes et travaillez sur Mac ? Cogilog Compta est l’outil adapté à vos besoins. Les PME, mais également les TPE, apprécient la performance d’un outil disponible tout le temps, non dépendant d’une connexion internet.

Ses avantages :

• des fonctionnalités complètes comprenant l’automatisation des écritures comptables, mais aussi le lettrage des comptes ou le rapprochement bancaire,
• répond à toutes les obligations comptables, quel que soit votre statut (SARL, profession libérale, SA,associations, etc.),
• la génération d’états facilement exploitables,
• l’import facile de factures fournisseurs générées avec Yooz, Azopio, ReceiptBank ou ZeenDoc,
• une suite globale de gestion grâce aux autres solutions Cogilog complémentaires (gestion des immobilisations, devis et facture, paye etc.),
• un tarif très avantageux par rapport à la moyenne des logiciels comptables B2B.

iPaidThat centralise tous vos documents comptables dans un seul outil. Il récupère vos factures depuis votre boîte de réception (Gmail et Outlook par exemple) ou depuis le site fournisseur dans votre espace client (accès à internet, énergie, hébergement de votre site, etc.). Ensuite, les données sont extraites automatiquement.

Ses avantages :

• vous gagnez en visibilité sur la santé financière de votre société,
• vous vous connectez avec votre banque et êtes notifié lorsqu’une transaction a été effectuée, mais qu’aucun document n’a été associé,
• vous gérez vos notes de frais : une photo du ticket suffit grâce au scanner mobile,
• iPaidThat est compatible avec tous les logiciels comptables du marché : Ciel, Sage, Cegid, EBP, OpenConcerto, etc.,
• le logiciel est simple et facile à utiliser.

Gérez votre comptabilité en ligne, mais aussi votre gestion commerciale (devis, factures) et votre liasse fiscale avec Itool Comptabilité. Cette solution est particulièrement adaptée aux PME, mais également aux TPE.

Ses avantages :

• des webconférences gratuites pour la prise en main, le paramétrage du compte, etc.,
• saisie intuitive et prise en main rapide : tableau de bord clair et facile d’utilisation. Avec la formule business, bénéficiez d’un tableau de bord dynamique,
• sécurité : vos données sont sauvegardées quotidiennement et protégées des incidents et virus,
• échange de données facilité avec votre expert-comptable,
• des mises à jour automatiques pour les nouvelles fonctionnalités et la législation en vigueur.

Sage 100c Comptabilité facilite vos procédures comptables. Vous gagnez en productivité en accélérant la saisie de vos données comptables. Ce logiciel propose des dossiers prêts à l’emploi, ainsi que des modèles d’écritures paramétrables. Vous contrôlez votre activité en suivant vos flux de trésorerie, les éventuels retards de vos clients, etc.

Ses avantages :

• des assistants simplifient la saisie des données,
• un suivi complet grâce aux indicateurs-clés de performance,
• des fonctionnalités modulables pour s’adapter à votre activité,
• une application mobile pour gérer votre comptabilité où que vous soyez,
• des services à la carte pour vous accompagner.

Sinao est une solution hébergée en France qui s’adresse aux PME, mais aussi aux autoentrepreneurs et TPE. Elle propose des fonctionnalités essentielles, sans superflu. L’interface a été pensée pour être conviviale. Sa simplicité d’utilisation, avec certaines tâches automatisées, est appréciable. La gestion administrative des ventes est facilitée et l’évolution des dépenses et de la trésorerie maîtrisée.

Ses avantages :

• données sécurisées : l’hébergement des données est en France,
• interface web adaptative et application mobile,
• fonctionnalités de réapprovisionnement, conversion de devis en facture et appel des retards de paiement,
• rapport qualité/prix,
• formation en ligne (webinaire).

Evoliz est une solution bien adaptée aux besoins des petites structures avec des fonctionnalités de comptabilité simples, incluant la facturation, les devis, la saisie des écritures comptables au journal, ainsi que la gestion des notes de frais et de la trésorerie.

Logiciel de gestion commerciale complet, il propose naturellement un tableau de bord avec des graphiques et des indicateurs clés pour offrir un pilotage intuitif et une vision à 360° sur la performance de votre entreprise, le tout en ligne et en temps réel (chiffre d’affaires, factures en retard, etc.).

Ses avantages :

• outil tout-en-un,
• conforme, certifié NF 203, anti-fraude à la TVA,
• synchronisation avec votre compte bancaire professionnel,
• automatisation des processus : collecte des factures depuis tous vos supports, enregistrement automatique d’une facture payée et mise à jour des stocks et de la fiche client, etc.

Exact Online est un logiciel collaboratif 3 en 1 créé pour vous aider à gérer votre comptabilité, mais également vos devis et factures et votre relation client avec le module CRM. Il permet un partage des tâches avec l’expert comptable pour suivre sa compta en toute quiétude. 

Cette solution est accessible en mobilité : vous gérez votre comptabilité partout et à tout moment grâce à des données fiables et actualisées en temps réel. Pour suivre votre activité de près et bénéficier d’une vue globale, des tableaux de bord de suivi avec indicateurs clés de performance sont disponibles dans l’outil.

Ses avantages :

• 100 % cloud,
• interface claire et intuitive, facilité de prise en main,
• solution modulaire : vous obtenez un outil sur mesure pour coller au plus près de vos besoins,
• gain de temps grâce à la gestion commerciale et la gestion comptable dans le même outil,
• échanges facilités avec votre expert-comptable.

Indy s’adresse aux professions libérales de la santé, du droit et du conseil au régime BNC. Il automatise simplement votre comptabilité, en vous évitant toute saisie manuelle pour un gain de temps très net.

Ses avantages :

• synchronisation avec votre banque (Indy recense jusqu’à 350 banques) et choix du compte professionnel,
• tri automatique de 90 % de vos transactions. Pour les 10 % restants, vous les classez en quelques clics,
• contrôle de vos revenus et de votre activité grâce au tableau de bord et aux graphiques,
• calculs automatisés des immobilisations,
• assistance en temps réel grâce à un chat.

Netwips est une solution 100 % en ligne permettant aux dirigeants de TPE et indépendants de gérer la comptabilité de leur entreprise en toute autonomie. Nul besoin de connaissances en comptabilité, l’application est pensée pour simplifier et automatiser la plupart des tâches. Elle ne nécessite aucune installation ni maintenance, et ne comporte pas de frais cachés.

Parmi les fonctionnalités de Netwips, nous pouvons relever :

• l’automatisation de la comptabilité avec la consignation et la catégorisation des opérations,
• la création des documents comptables (déclaration de TVA et exports comptables),
• le suivi en temps réel de la trésorerie de l’entreprise grâce au tableau de bord de l’application,
• la centralisation des documents financiers de l’organisation : factures, devis, notes de frais,
• l’accès partagé avec votre expert-comptable, etc.

Quickbooks est une solution américaine utilisée dans le monde entier principalement par des TPE. Quickbooks séduit rapidement ses utilisateurs grâce à son interface soignée. Ce logiciel de comptabilité ne permet pas de faire de saisie comptable, mais il excelle dans tout le reste.

Ses avantages :

• ergonomie parfaite : la navigation, la saisie et la restitution des informations sont idéales pour les petites entreprises,
• gestion de toutes les devises,
• synchronisation bancaire avec un nombre impressionnant de Banque Nationale et internationales.

Wity est un cabinet global 100 % en ligne regroupant des expertises en comptabilité, en droit et en stratégie pour vous accompagner sur tous ces sujets afin d’optimiser le pilotage de votre activité, quel que soit votre profil d’entrepreneur, du créateur de start-up au dirigeant de TPE/PME en passant par l’autoentrepreneur. Vous pouvez vous concentrer sur votre métier, Wity automatise le reste.

Avec Wity, vous bénéficiez des avantages suivants :

• un tableau de bord complet permettant un affichage clair des indicateurs de performance,
• la comptabilité automatisée, aucune saisie à réaliser,
• la synchronisation des comptes bancaires et la catégorisation des opérations,
• le contact avec un comptable dédié à tout moment de la journée,
• des données sécurisées, sauvegardées et hébergées en France.

Appvizer vous guide dans les critères à prendre en compte pour choisir le logiciel de comptabilité qui correspond à vos besoins. Pour poursuivre votre réflexion, si vous ne savez pas par où commencer, vous pouvez demander de l’aide à votre expert-comptable si vous y faites appel. Il saura vous aiguiller sur les aspects métier à retenir dans votre choix.

Pour faire simple, vous avez deux questions principales à vous poser :

Si l’on rentre dans le détail, voici quelques exemples de questions à vous poser pour être sûr de faire le bon choix :

• Quelle est la taille de votre entreprise ? Certaines solutions comptables sont davantage orientées pour les TPE, les PME ou les grandes entreprises.
• Vous faut-il un logiciel spécifique pour votre secteur d’activité ?
• Faites-vous appel à un expert-comptable ? Si oui, comment gérer la communication avec lui ?
• L’application doit-elle traiter uniquement la comptabilité ou inclure d’autres fonctionnalités de gestion (facturation, gestion des encaissements, etc.) ?
• Votre logiciel de comptabilité doit-il être connecté avec vos outils existants ?
• Souhaitez-vous gérer votre comptabilité via un tableau de bord ?
• Combien d’utilisateurs accèdent aux données ?
• Quel niveau de protection des données exigez-vous ?
• Êtes-vous prêts à vous former à un outil, ou la prise en main doit-elle être immédiate ?

Quoi qu’il en soit, n’oubliez pas que les logiciels pros proposent bien souvent des versions d’évaluation gratuites. Vous pouvez ainsi essayer l’outil et confirmer (ou non) votre choix avant d’investir.

Voici quelques fonctionnalités importantes dont vous pourriez avoir besoin qui seront à prendre en compte pour choisir le logiciel de comptabilité adapté :

• Une bonne ergonomie de l’interface : évitez de choisir un logiciel de gestion commerciale — difficile à comprendre et à utiliser.
• La saisie des écritures comptables : la saisie basique des données avec l’import et l’export est la solution la plus efficace. 
• Le suivi des comptes-tiers : afin de connaître les mouvements des comptes liés à vos partenaires et salariés.
• La déclaration de la TVA si vous y êtes assujetti.
• La réalisation d’un prévisionnel analytique : permet d’avoir une vision à long terme de l’évolution potentielle de votre entreprise.
• La possibilité d’exporter les écritures comptables et d’élaborer plus facilement la liasse fiscale.
• Le tableau de bord pour avoir une vision synthétique de la situation comptable de l’entreprise

💡 Dernier conseil pour vous aider dans votre décision, vérifiez que votre logiciel comptable :

• Dispose d’une fonctionnalité d’export du fichier des écritures comptables (FEC). Ce fichier est à présenter à l’administration fiscale en cas de contrôle. Évitez les mauvaises surprises…
• Respecte la réglementation en matière de sécurisation, conservation et inaltérabilité des données.

Les logiciels de comptabilité foisonnent sur le marché. Alors, comment choisir celui qui correspond aux besoins de votre entreprise ? Votre budget vous contraint-il à un logiciel gratuit ou pouvez-vous vous orienter vers un logiciel pro plus complet ? Quelles fonctionnalités vous sont essentielles et lesquelles sont accessoires pour votre activité ?

En fonction de vos connaissances en comptabilité, et donc de vos besoins de formation, vous vous orienterez plutôt vers un logiciel à la prise en main facile comme Itool Comptabilité, ou plutôt vers un logiciel plus complexe comme Ciel Comptabilité qui propose des formations aux utilisateurs.
Les logiciels comptables sont aujourd’hui collaboratifs et accessibles de partout par internet. Leurs fonctionnalités sont étendues et incluent aussi parfois des fonctionnalités de gestion.

Peu importe le logiciel que vous choisirez, il vous permettra d’optimiser vos processus comptables et de produire des écritures comptables plus facilement. Vous n’avez plus qu’à essayer une version d’évaluation !

Article mis à jour, publié initialement en avril 2018.