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Auto-entrepreneurs : 12 logiciels de facturation rien que pour vous !

Par Rita Hassani Idrissi • Le 28 janvier 2026

Facturer vite, bien et sans prise de tête... voici tout l’enjeu quand on est auto-entrepreneur ou freelance. Entre les obligations légales, le suivi des paiements et la gestion quotidienne de l’activité, difficile de se permettre de composer avec un outil approximatif.

Les micro-entreprises ont des attentes spécifiques : un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur doit être intuitif, fiable et financièrement accessible.

Dans ce guide, on vous aide à identifier la solution la plus adaptée à votre activité, pour gagner du temps tout en restant parfaitement en règle.

👀 Zoom sur les 12 applications de facturation les plus performantes pour les auto-entrepreneurs :

Les obligations liées à la facturation des auto-entrepreneurs

En micro-entreprise, la facturation obéit à des règles précises, même si elle n’est pas systématiquement obligatoire.

Concrètement, en tant qu’auto-entrepreneur, vous êtes légalement tenu d'émettre une facture dans les cas suivants :

  • la vente ou prestation à destination d’un client professionnel, quel que soit le montant ;
  • la vente à distance (e-commerce, vente en ligne, etc.) ;
  • les livraisons intracommunautaires exonérées de TVA ;
  • à la demande expresse d’un client particulier, indépendamment du montant facturé.

Dès lors qu’une facture est émise, il convient d'y faire figurer certaines mentions légales, sous peine de sanctions en cas de contrôle (identité de l’auto-entrepreneur, date d’émission, numérotation, détail des prestations, montants, mention « TVA non applicable – article 293B du CGI » le cas échéant, etc.).

Pourquoi utiliser un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur ?

Si aucun texte n’impose aujourd’hui aux auto-entrepreneurs de recourir à un logiciel de devis et de facturation, son utilisation est fortement recommandée pour des raisons très concrètes :

  • la réduction des tâches administratives chronophages ;
  • la diminution des risques d’erreurs ou d’oublis ;
  • l’automatisation de la création des devis et factures ;
  • la centralisation des informations clients et du suivi des paiements.

🤩 C'est pourquoi on vous propose une sélection des meilleurs logiciels de facturation adaptés aux micro-entreprises, évalués selon les critères opérationnels suivants :

  • la notoriété et la fiabilité de la plateforme ;
  • la facilité d’utilisation (ergonomie, interface, prise en main, etc.) ;
  • le respect des exigences en matière de protection des données (RGPD, sécurité, etc.) ;
  • la pertinence des fonctionnalités liées à la facturation ;
  • l’accessibilité tarifaire et la qualité du support client ;
  • le niveau d’automatisation des tâches administratives.

Tableau comparatif des 12 meilleurs logiciels de facturation pour auto-entrepreneurs

Abby

Sage 50

Factomos

Freebe

Henrri

Indy

MonAE

Solo

MY Facturation

Sinao

Tiime

Zervant

Pour les entreprises d'un salariéPour entreprises de 1 à 50 salariésPour entreprises de 1 à 50 salariésPour les entreprises d'un salariéPour entreprises de 1 à 250 salariésPour entreprises de 1 à 50 salariésPour toutes les entreprisesPour toutes les entreprisesPour entreprises de 2 à 250 salariésPour entreprises de 1 à 5000 salariésPour entreprises de 1 à 50 salariésPour entreprises de 1 à 250 salariés
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Version payante dès 9,00 € /mois

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Version payante dès 25,00 € /mois

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Version payante dès 5,00 € /mois

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Version payante dès 15,00 € /mois

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Version payante dès 15,00 € /mois

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Version payante dès 12,00 € /mois

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Version payante dès 3,00 € /mois

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Version payante dès 19,90 € /mois

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Version payante dès 20,00 € /mois

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Version payante dès 29,00 € /mois

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Version payante dès 17,99 € /mois

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Version payante dès 9,00 € /mois

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Abby

Présentation du logiciel

Abby se présente comme un logiciel de gestion d’entreprise complet, spécifiquement adressé aux besoins des auto-entrepreneurs. C’est donc tout naturellement qu’il propose un module facturation, pour gérer simplement et de bout en bout vos devis et factures.

Mais Abby ne s’arrête pas là, puisqu’il intègre d’autres services clés pour les indépendants : comptabilité, déclaration du chiffre d’affaires ou encore pilotage des activités.

Les points forts d’Abby

  • Abby propose une gamme de fonctionnalités complète et opère sur les trois principaux piliers de la micro-entreprise : facturation, comptabilité et déclaration.
  • Il vous permet de créer en quelques clics des factures et des devis personnalisés, conformes aux règles en vigueur.
  • Gagnez du temps grâce à l’automatisation des processus de relance ou de gestion de la facturation récurrente.
  • Fluidifiez les échanges avec vos clients via les services de paiement en ligne ou de signature électronique disponibles dans Abby.
  • L’interface de la solution, très ergonomique, est pensée pour simplifier sa prise en main et son utilisation au quotidien.

Tarifs

Gratuit, avec l’offre Basique, plus réduite en fonctionnalités.

À partir de 9 € par mois pour le Forfait Start.

Factomos

Présentation du logiciel

Factomos est un logiciel de facturation made in France à destination des auto-entrepreneurs.

Les utilisateurs l'apprécient particulièrement pour sa prise en main intuitive et rapide. Solution complète, elle saura vous accompagner dans la gestion commerciale et financière de votre activité.

Les points forts de Factomos

  • La création de devis personnalisés s'exécute en quelques clics, et les transformer en facture se fait tout aussi rapidement.
  • Relancez automatiquement vos clients pour les factures impayées et accélérez leur règlement.
  • La synchronisation de Factomos avec votre ou vos comptes bancaires vous permet de garder un œil en temps réel sur votre trésorerie.
  • Grâce à l’enregistrement automatique et la centralisation des justificatifs comptables (notes de frais, factures d’achat, tickets de caisse, etc.) directement dans l’interface, vous retrouvez rapidement un document et facilitez le travail à votre expert-comptable.
  • La gestion des factures d’acompte et des factures récurrentes s’adapte à tout type d’activité.

Tarifs

À partir de 9 € HT/mois.

Freebe

© Freebe

Présentation du logiciel

Freebe est un logiciel de facturation.... mais pas que. Spécialement conçu pour faciliter le quotidien des freelances et des auto-entrepreneurs : il vous accompagne tout au long de vos missions, de la création du devis jusqu’à la comptabilité, en passant par la facturation.

​​Les points forts de Freebe

  • Côté facturation, il permet d’éditer des factures directement à partir d’un devis et peut récupérer automatiquement les données client ainsi que les autres éléments obligatoires.
  • Pour maximiser vos chances d’être payé rapidement, bénéficiez d'une fonction automatique de rappel aux clients en retard, ainsi que d’un lien de paiement intégré directement dans la facture.
  • Avec son dashboard, vous suivez en temps réel l’état de ses finances. Essentiel pour devenir bon gestionnaire !
  • Freebe peut gérer pour vous la déclaration de votre chiffre d’affaires à l’URSSAF, dans le respect du calendrier des échéances. 
  • Via l'accès à une base de données professionnelle, vous récupérez automatiquement les coordonnées des entreprises afin de les afficher sur les factures.

Tarifs

À partir de 7 €/mois.

Henrri

© Henrri

Présentation du logiciel

Henrri est un logiciel de facturation pour auto entrepreneur gratuit. Il a été créé avec un objectif clair : faciliter le quotidien des entrepreneurs et des petites entreprises.

L'outil propose des fonctionnalités aussi variées qu’utiles : facturation, devis, comptabilité, relances automatiques des impayés, tableaux de reporting, personnalisation de documents, et bien d’autres encore.

Les points forts d'Henrri

  • De par la richesse des fonctionnalités disponibles, vous n'avez pas besoin de débourser 1 euro. Un sacré avantage quand on débute son activité !
  • Son intuitivité assure une prise en main rapide sans besoin de formation.
  • Henrri protège vos données en les hébergeant sur des serveurs situés en France, effectue une double sauvegarde (on ne sait jamais) et propose un accès sécurisé pour tous les utilisateurs de la solution.
  • L’automatisation de certains processus permet de ne pas dépenser son énergie à relancer les clients qui n’ont pas réglé leurs factures, par exemple.
  • L’accompagnement et la présence de l’équipe d’Henrri auprès de ses clients se révèle un atout de taille pour un logiciel gratuit. 

Tarifs

Henrri est entièrement gratuit.

Indy

Présentation du logiciel

À destination des travailleurs indépendants et auto-entrepreneurs, Indy vous soutient efficacement dans l’exécution de vos processus liés à la création d’entreprise, à la comptabilité, à la facturation et devis, aux comptes pro ainsi qu’au bilan et aux déclarations.

Très accessible au niveau du prix et de l’utilisation, ce logiciel saura satisfaire l’essentiel de vos besoins en matière de gestion quotidienne, et vous fera gagner un temps précieux.

Les points forts d’Indy

  • La plupart des fonctionnalités d’Indy sont disponibles gratuitement, dont la création de factures et devis personnalisés en illimité.
  • La solution assure le suivi automatique de vos paiements et acquittements de facture. En cas de besoin, la relance client s’exécute en un clic.
  • Avec la synchronisation bancaire, liez vos factures acquittées aux transactions correspondantes afin de simplifier le traitement comptable.
  • En utilisant Indy, vous garantissez votre conformité à la réforme de la facturation électronique à venir.
  • Bénéficiez d’un accompagnement optimal de la part de l’éditeur, dont une assistance disponible en temps réel par chat.

Tarifs

Le module devis et facturation est 100 % gratuit.

Si vous souhaitez des fonctionnalités supplémentaires (rappels d’obligations et d’échéances, déclaration et télétransmission, etc.), il vous faudra passer à l’offre Plus, disponible à 9 €/mois HT.

MonAE

Présentation du logiciel

MonAE est un logiciel de gestion intelligent conçu spécialement pour automatiser et simplifier le pilotage des micro entreprises. L'outil fait tout à votre place ! De la déclaration de votre chiffre d’affaires à la mise à jour automatique de votre livre de recettes, en passant par le tri de vos factures et devis.

​​Les points forts de MonAE

  • Son système tout-en-un et la richesse de ses fonctionnalités prennent en charge l’automatisation des processus de vente, l’analytique, la comptabilité, la facturation et la gestion documentaire dans une seule et même plateforme.
  • Sa fonctionnalité de facturation à l’étranger en devises étrangères gère automatiquement la conversion en euros de vos encaissements.
  • Son suivi client efficace et optimal vous permet de saisir l’intégralité des coordonnées et informations du client. 
  • Ses certifications et système de protection des données sont conformes aux règlementations.
  • Vous avez la possibilité de déléguer les tâches complexes à une équipe de conseillers spécialisés (conseillère à la Sécurité sociale, agent des impôts, etc.).

Tarifs

Le prix du logiciel n’est fait que sur demande. Un essai gratuit est disponible.

Solo, par Mon Portail Auto-Entrepreneur

Présentation du logiciel

Solo, édité par le bien connu Portail Auto-Entrepreneur, est un logiciel de gestion complet qui accompagne les auto-entrepreneurs de A à Z, de la création de leur entreprise au pilotage quotidien de leur activité. Il intègre toutes les fonctionnalités indispensables : création de devis et de factures, paiement en ligne, et suivi des cotisations.

Particulièrement intuitif, Solo se distingue par son accompagnement personnalisé et ses outils pédagogiques qui simplifient vos obligations (déclarations de chiffre d'affaires, calcul de la TVA, CFE, etc.). C’est la solution idéale pour les indépendants qui cherchent à centraliser leur gestion administrative sur une plateforme sécurisée et 100 % conforme.

Les points forts de Solo

  • Éditez en quelques clics des devis et factures conformes aux dernières réglementations françaises.
  • Visualisez instantanément le montant de vos cotisations sociales et de vos impôts à prévoir selon votre chiffre d'affaires.
  • Accélérez vos règlements en proposant à vos clients de payer leurs factures directement par carte bancaire via un lien sécurisé.
  • Suivez l'évolution de votre activité, vos seuils de chiffre d'affaires et votre rentabilité dans des tableaux de bord via une interface claire et moderne.
  • Profitez d'un support dédié composé de spécialistes de la micro-entreprise pour répondre à toutes vos interrogations administratives.

Tarifs

Solo propose une version gratuite pour les besoins basiques. Les offres avec accompagnement et fonctionnalités avancées débutent à partir de 19,90 € / mois.

MY Facturation

Présentation du logiciel

MY Facturation est une solution digitale française qui vous permet de gérer vos devis et votre facturation… gratuitement !

Vous pouvez également souscrire à des modules payants afin d'accéder à plus de fonctionnalités (gestion des contrats, comptabilité, etc.).

Les points forts de MY Facturation

  • Profitez de la création rapide de vos devis et factures, ainsi que de leur envoi en un clic à vos clients.
  • Le logiciel permet un suivi clair de l’état de vos factures avec l’affichage d’une barre de progression mise à jour automatiquement et en temps réel.
  • Son application mobile est bien pratique pour accéder à tout moment à vos documents et garder un œil sur la trésorerie de votre activité.
  • Les données sont hébergées sur des serveurs en France avec une double sauvegarde pour plus de sécurité.
  • MY Facturation prend en compte le format e-facture.

Tarifs

Gratuit.

Sage 50

Présentation du logiciel

Développé par un éditeur riche d’une expertise de 35 ans sur le marché français, Sage 50 accompagne les petites entreprises et les auto-entrepreneurs dans leur pilotage comptable et commercial.

Côté fonctionnalités, la solution prend bien entendu en charge la facturation, mais aussi la comptabilité ou encore la gestion des stocks.

Les points forts de MY Facturation

  • Éditez en toute simplicité des devis et factures parfaitement conformes. Les devis sont automatiquement convertis en factures si validation du client.
  • Obtenez plus rapidement vos règlements grâce aux relances automatiques ainsi qu’aux paiements en ligne (SEPA, Stripe et PayPal).
  • Sage est immatriculé Plateforme Agréée, gage de sa conformité avec la réforme de la facturation électronique.
  • Les factures sont traduites en écritures comptables dans le module comptabilité du logiciel.
  • Il est possible de personnaliser votre solution.

Tarifs

Le module Devis et facturation est disponible à partir de 20 € HT/mois.

Sinao

Présentation du logiciel

Sinao est un logiciel de gestion et de facturation gratuit pour les micro-entrepreneurs, qui permet d'assurer une excellente gestion comptable, sans superflu.

La plateforme va à l’essentiel et propose des fonctionnalités pertinentes, qui vous accompagneront tout au long de votre activité financière et comptable.

​​Les points forts de Sinao

  • Sa fonctionnalité d’édition de factures et de devis très efficace vous donne accès à des templates de factures complètes et conformes, avec des mentions légales pré-remplies.
  • Son système de facturation récurrente automatise la facturation de vos abonnements et contrats.
  • La synchronisation de votre système de facturation avec votre stock vous permet de suivre en temps réel les quantités disponibles
  • Avec sa fonctionnalité de rapprochement bancaire très pertinente, vous détectez les mouvements correspondants de sorte à les associer automatiquement à votre compte.
  • Son support technique performant et ultra réactif (moins de 5 minutes) vous donne accès à une équipe de conseillers 24h/24.

Tarifs

Sinao propose une formule gratuite. Les plans payants commencent à 11,40 €/mois, avec l'offre Start.

Tiime

Présentation du logiciel 

La solution de facturation et de comptabilité Tiime  a déjà été adoptée par plus de 100 000 entrepreneurs.

Intuitif et facile d’accès, ce logiciel s’occupe de simplifier la vie des auto-entrepreneurs en gérant leur devis, factures, suivi et relances depuis une seule application. 

Les points forts de Tiime

  • Depuis le web ou sur mobile, éditez et personnalisez vos factures en fonction de votre secteur gratuitement (facturation récurrente, duplication de facturation, Factur-X, notes de frais, etc.). 
  • Tiime intègre des fonctionnalités dédiées aux remises, acomptes et relances
  • La saisie des écritures comptables est rapide et efficace grâce à une IA capable d'identifier les informations d’une facture pour les transférer directement sur l’application.
  • Profitez d'une interface particulièrement intuitive et user-friendly.
  • En cas de retard de paiement de la part d’un client, vous recevez une alerte et pouvez lui envoyer un mail en un clic afin de le relancer.

Tarifs

Offre Free gratuite, et offre Start disponible dès 17,99 €.

Zervant

Présentation du logiciel

Zervant est un logiciel de facturation gratuit pour les TPE et petites structures. Il vous aide à réaliser vos devis et factures très rapidement et de manière entièrement intuitive.

Ses nombreuses fonctionnalités, alliant comptabilité, facturation et administration, en font une véritable plateforme tout-en-un.

​​Les points forts de Zervant

  • Le logiciel génère automatiquement votre livre de recettes, quasiment le seul document comptable nécessaire aux micro-entrepreneurs
  • Ses nombreuses options d’envoi de facture vous permettent de satisfaire les différents besoins de vos clients : envoi par voie postale, e-mail ou e-facture (avec Chorus Pro).
  • Grâce aux calendriers de paiement ultra-personnalisés, vous gagnez en flexibilité et effectuez un suivi plus complet.
  • Envoyez des factures électroniques aux entités publiques directement depuis votre compte, en un clic !
  • Zervant est disponible en 6 langues (Allemand, Anglais, Finnois, Français, Néerlandais, Suédois).

Tarifs

Zervant est totalement gratuit pour les micro-entreprises ne dépassant pas les 5 clients. La fomule Start commence à 9 €/mois.

Logiciel de facturation pour auto-entrepreneur - La FAQ

Un auto-entrepreneur peut-il utiliser un logiciel de facturation gratuit ?

On l'a vu, nombre d'éditeurs proposent des versions gratuites adaptées aux besoins basiques des micro-entrepreneurs.

Elles conviennent généralement aux activités avec un faible volume de factures, mais peuvent rapidement montrer leurs limites dès que l’activité se développe (plafonds, fonctionnalités restreintes, support limité, etc.).

Un logiciel de facturation auto-entrepreneur doit-il être certifié ?

La certification anti-fraude à la TVA n’est pas obligatoire pour les auto-entrepreneurs bénéficiant de la franchise en base de TVA.

En revanche, le logiciel doit garantir l’inaltérabilité, la sécurisation et l’archivage des factures, notamment en cas de contrôle.

Peut-on gérer les devis et factures depuis un smartphone ?

Oui, la majorité des logiciels de facturation modernes proposent une interface mobile ou une application dédiée.

Ainsi, vous créez un devis, transformez une facture ou suivez les paiements directement depuis votre smartphone. Un vrai plus si vous êtes souvent en déplacement !

Combien coûte un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur ?

Les tarifs varient généralement de 0 à 20 € par mois, selon les fonctionnalités incluses (automatisation, relances, exports comptables, support, etc.).

Le bon choix de logiciel dépend avant tout du volume de facturation et du niveau d’accompagnement recherché.

Rita Hassani Idrissi

Rita Hassani Idrissi, Content & Event Manager

En tant que Content & Event Manager chez Axialys, Rita Hassani Idrissi a une expertise particulière dans les solutions VoIP et la relation client. Titulaire d'un double diplôme de Master PGE et MSc en Marketing et Innovation Produit de l'ICN Business School, elle a acquis une solide formation en marketing et commerce. Son parcours lui a permis de développer des compétences approfondies en gestion de contenu, organisation d'événements et communication stratégique. Elle a également contribué en tant qu'auteure à des plateformes telles qu'Appvizer et Digital CMO, partageant ses analyses sur les tendances du marché et les innovations en matière de relation client et de transformation numérique.